부가가치세법에 따라 발급한 세금계산서의 공급가액은 종합소득세 총수입금액을 구성하는 기초 자료가 됩니다. 세금계산서 발급액은 사업소득 발생을 증빙하는 핵심 지표이며, 종합소득세 과세표준을 산정하는 출발점이 됩니다.

세금계산서와 종합소득세 수입금액의 연동 기준은 무엇인가요?

거주자의 사업소득에 대한 총수입금액은 해당 과세기간에 수입했거나 수입할 금액의 합계액으로 계산합니다. 「부가가치세법」에 따라 재화나 용역을 공급하고 발급한 세금계산서의 공급가액은 「소득세법」상 총수입금액에 산입하는 것이 원칙입니다.

종합소득세 신고 시에는 부가가치세 신고로 확정된 과세표준과 소득세법상 수입금액을 비교하며, 그 차이는 「소득세법 시행령」에 따른 조정후총수입금액명세서로 관리합니다. 세금계산서를 발급했더라도 다음 항목은 총수입금액 계산 시 제외하거나 차감하여 조정합니다.

수입금액 불일치에 따른 소명 대상 여부를 확인하려면

• 매출에누리나 환입 또는 약정에 따른 매출할인이 발생했는지 확인하여 총수입금액에서 적절히 제외하거나 차감
• 사업용 고정자산을 매각하여 세금계산서를 발급한 경우 본인의 장부기장 의무 유형에 따라 수입금액 제외 대상인지 점검
• 세금계산서 발급액과 실제 수입금액의 차이가 큰 경우 세무서의 조사나 확인 대상이 될 수 있으므로 불일치 사유를 미리 파악